Pendirian LAZ Baitul Mal FKAM sendiri bermula dari hanya perkumpulan remaja yang sering berkumpul di masjid wilayah eks Karisidenan Surakarta, ketika terjadi bencana yang melanda Aceh pada tahun 2004 (Tsunami) dan kemudian peristiwa erupsi dan gempa di Daerah Istimewa Yogyakarta dan Klaten pada tahun 2006 para remaja-remaja ini ikut turun aksi dalam membantu acara kemanusiaan tersebut, pada waktu itu para remaja-remaja tersebut berfikir bahwa perlu untuk didirikannya sebuah lembaga yang mampu untuk menopang semua kegiatan dakwah dan kemanusiaan.