Dana yang terkumpul dalam Program Wakaf Pembangunan Masjid dan Wakaf Sumur Yayasan Misik akan dialokasikan secara transparan dan efisien sesuai dengan kebutuhan lapangan. Dana akan digunakan untuk pembangunan masjid, material konstruksi, tenaga kerja, serta fasilitas pendukung seperti tempat wudhu, perlengkapan ibadah, dan sarana pendidikan. Kemudian dialokasikan untuk pembangunan sumur wakaf, termasuk biaya pengeboran, pemasangan pompa air, pembangunan penampungan air, serta distribusi ke masyarakat sekitar. Sisanya, akan digunakan untuk operasional program, seperti survei lokasi, koordinasi dengan pihak terkait, pelaporan transparansi kepada donatur, serta kegiatan sosialisasi guna meningkatkan partisipasi masyarakat dalam program wakaf ini.